L'Observatoire du Végétal

L'Observatoire du Végétal (OV) est un ensemble de ressources dédiées au phénotypage multi-niveaux des plantes. Il est adossé à l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal (IJPB), une unité mixte INRAE et AgroParisTech, située sur le Centre INRAE Ile-de-France - Versailles-Saclay.

Objectif

L’objectif est de réaliser une analyse intégrée et à haut débit des plantes, alliant phénotypage macroscopique, biochimique, cytologique, chimique et métabolique. L'OV comprend 5 plateformes techniques et le Centre de Ressources Biologiques (CRB) Arabidopsis Versailles (VASC). L’OV forme ainsi un ensemble homogène et important de ressources génétiques, d’équipements de culture de plantes, de phénotypage, d’imagerie, de biochimie ainsi que d’analyses métabolique et chimique répartis dans des sous-ensembles thématiques.

Ce cluster de plateformes intégrées dédiées au phénotypage des plantes représente une structure unique qui permet aux utilisateurs une caractérisation à des niveaux multiples d’échantillons végétaux produits in situ.

Ce dispositif est majoritairement basé sur la plante modèle Arabidopsis thaliana (ou Arabette des dames), mais accueille également des projets concernant d’autres modèles comme Brachypodium dystachion, ainsi que des plantes cultivées  (maïs, pois, lin, colza, coton, orge, blé, etc.

Principales prestations

L’OV met ses infrastructures à disposition de la communauté scientifique et des industriels et offre des prestations telles que :

• Culture de plantes dans une grande variété de climats en enceinte contrôlées ou en serre avec différents niveaux de sécurité biologique (organismes de quarantaine, S2 et S3).
• Imagerie végétale : microscopie visible et confocale, hybridationin situ, dissection laser, microscopie électronique, cytométrie de flux, localisation sub-cellulaire et dynamique, immunolocalisation et FISH.
• Phénotypage automatisé / robots de phénotypage macroscopique par imagerie visible, infra-rouge et fluorescence.
• Chimie analytique de composés issus de la plante : analyse de métabolites primaires et secondaires, dosage et caractérisation de lipides et d’hormones, caractérisation et dosage des polysaccharides pariétaux.
• Etude fonctionnelle et structurale des protéines, analyse protéomique.
• Propagation, stockage et distribution de matériel génétique.

Labels

	Label CNOC (Commission Nationale des Outils Collectifs) depuis 2013.
	Label Ibisa (Infrastructures en biologie santé et agronomie) depuis 2012.